农用微生物菌剂肥料不仅在农作物上有着良好的应用效果，而且对于盆栽花卉以及地栽花卉的病害，像白粉病、锈病、叶斑病等病害的防治上都有着一定的防治效果，增强花卉植株对于病害的抵抗能力，有效提高花卉的成活率。
      对于花卉植株病害的防治效果主要体现在以下几点上，菌剂肥料中的菌可以在植株根部周围形成一个效果良好的微生物菌群，这个菌群可以占用土壤中有害菌的生存空间，并且夺取有害菌生存所需的营养成分，明显减少土壤中有害菌的数量，并且加大有益菌的数量。减少土壤传播病害的发生；植株的根部不会受到病害侵袭了，那么根部的长势自然而然就好了，所以对于营养的吸收力度就会加大，植物营养吸收多了，就会使植株生长更加旺盛，开花也会更好看。
     另外这种产品没有任何的副作用或者是不良的影响，不管用多少，怎么用，都不会对花卉植株造成任何的危害或者是污染，是一种十分环保健康的产品。不像以往的花卉肥料产品，或多或少都会对环境、土壤、花卉造成一定的危害。这也是这种产品最重要的一个特点。
     在花卉上施用农用微生物菌剂肥料不仅仅是对于病害有很好的一个效果，试验证明，该产品在虫害上也是有很好的一个防治作用。所以正确施用这种产品可以很好的促进花卉植株的生长以及开花时间的延长，花色艳丽、叶片繁茂。